是的，一般纳税人的废旧物资处理收入可以按简易计税5%计缴增值税。依据《中华人民共和国增值税暂行条例》第十二条规定，销售废旧物资、不能再利用的物资和无用废弃物、以及物资回收加工经营（收购）收入所得，属于简易计税办法所得。简易计税办法，其应税销售额采用实际收入，减去实际发生的费用，税率为5%，不计入销项税额。因此，公司自己采购配件维修自有汽车，换下来的且不能二次利用的废旧配件和废旧轮胎，这些废旧物资处理收入，按简易计税5%计缴增值税是可以的。拓展知识：计税依据是根据税法规定的条件，判断企业的收入是否应缴纳税款的依据。税法主要参照物是企业的实际经营收入，而不是企业的利润。