公司与农户合作种植的账务处理包括以下步骤： 1、首先，农户应向公司支付农肥、种子、农药的费用； 2、秋收期间，公司应为农户提供技术服务，包括农药、农肥的使用、植物防病防虫、收获等； 3、耕作期间，公司把提供的费用支付给农户，秋收期间，根据收成情况，确定对农户的报酬； 4、根据产品收获量，统计和计算每户所收获产品数量及价格； 5、结算所有农户的产品收获，以及公司付给农户的报酬； 6、根据实际结果，及时准确的录入总账及明细账等账务凭证，将费用和收益及时核算登记。 上述账务处理步骤只是公司与农户合作种植的一般流程，实际上，还应根据具体的合作形式调整账务处理步骤，以确保账务准确、一致，并易于监控。此外，应加强农户及公司收缴税款的管理，准确报告公司和农户之间税费缴纳情况，有效税收落实。另外，公司应做好继续增加对农户的技术支持，以提高产量。