处理专票上发票联抵扣联加盖财务专用章的方法是： 首先，将专用章放置在财务专用章的位置，将抵扣联或发票联打印到规定的卡纸上，然后用财务专用章盖在正确的位置上，最后将专用章印到适当的位置上。 拓展知识：财务专用章是企业财务对外签署合同和开具发票的重要的法定凭证，是财务部门的必备印章，它具有法律效力，是企业的资产。因此，法律要求，专用章由财务部门或公司管理领导委托负责人保管使用。