处理这种情况，首先需要确认这次1000货款究竟是谁出账的，如果此次1000货款是客户出账，你可以要求客户将1000货款再次转账汇款至你另一个账户，即实现金额的复原；若此次1000货款是公司出账，你也可以在提现的同时，在银行凭证上写明“现金归还”，以证明这1000元是归还客户的金额，而不是收入金额。另外，为了避免出现此类问题，最好的办法是做好对金额的统计和记录，并结合实际情况按时给出分账报表，能够有效地跟踪账户资金流向。