根据《企业会计准则》的有关规定，民办非营利学校的食堂应当独立核算，并按照财务会计准则进行登记和核算。首先，食堂需要办理食品经营许可证，该许可证由当地食品药品监督管理部门颁发。其次，根据学校的情况，可以采取员工免费或学生充值刷卡等方式进行经营。再者，需要对食堂业务经营进行独立核算，并做好资产负债表、损益表等财务报表和流水账，把握食堂的财务收支情况。此外，还要按照《企业会计准则》要求做好内部控制，如货物入库、出库的核算，防止不合理支出和资金流失。 拓展知识：企业会计准则（Enterprise Financial Accounting Standards）是一类财务会计准则，由中国会计准则委员会制定，旨在指导企业会计核算，以达到财务会计信息准确、可靠的目的。