是的，如果两家公司发工资加起来没有超过12万，在年终汇算清缴的时候仍然需要缴纳个税。根据2019年最新的个税法规，每一位公民的年度累计收入超过3500元（不含3500元），年终汇算清缴时都需要缴纳个税。两家公司发放的工资一般都超过3500元，所以无论有没有超过12万，到年终汇算清缴时都需要缴纳个税。 个税收入范围及应纳税所得额计算比例表格是2019年最新的个税法规，各级税务部门将根据此表格计算及征收个人所得税。例如，每位公民收入超过3500元（不含3500元），当月应缴纳的个税计算方法为：实际收入 x 税率 = 应纳税所得额， 应纳税所得额 x 税率 = 税额。 总而言之，如果两家公司发放的工资加起来没有超过12万，在年终汇算清缴的时候也要缴纳个税，具体应该缴纳多少个税还需要根据2019年最新的个税法规计算。