员工请假扣除工资的分录应该是：应付职工薪酬——借，应付假期报酬——贷。其中，应付职工薪酬账户应该是该借方科目，而应付假期报酬账户应该是贷方科目。两个科目都计入实际发生费用（即应付职工薪酬减去应付假期报酬）。 这里应该注意的是，将实际发生的费用分配到具体的科目，这一点对会计准确性很重要，科目的选择也要根据企业的会计准则来确定。此外，有时企业会将请假的费用转移到下个会计期间，来延期记账，此时还需要考虑期间变动的准确性。 拓展知识： 会计的分录可以分为两类，即借贷分录和现金流量分录。借贷分录是最基本的分录方式，也是最常用的，尤其在处理财务交易时，借贷分录是最重要的部分，因为它可以表明企业的财务状态。现金流量分录是在进行现金流量分析时使用的分录，它可以显示收支变化的趋势，从而更好的把握企业的财务状况。