在核销欠款情况下，财务部门应该先清算分公司欠总公司的款项和利息，然后减去当时相关内部账户里的欠款。财务部门需要分别核对两边的科目明细，比对凭证，确保清算无误，并将核销记录到账本上。最后，财务部门还要制作一份本次核销清单，详细说明核销金额，核销日期，核销情况等，作为财务报表的一部分。 拓展知识：三方核销是在多方都有欠款和债务的情况下，由三方协商，核销清算的一种做法，其中，每一方支付自己拥有的欠款和债务，并参与其他两个方的清算。三方核邮件可以减少费用，提高内部的经济效率，同时也可以增强彼此之间的债权责任意识。