对于个体工商户，一般不需要申报自然人扣缴系统。根据《中华人民共和国企业所得税法》第四十五条的规定，个体工商户的法定代表人、负责人以及其他从业人员的个人所得税，应交纳至县级以上地方税务机关指定的所得税收入缴纳地的缴纳地税费科、局（收）办公室。因此，目前只有一人法人的个体工商户，并不需要申报自然人扣缴系统。 拓展知识：一般来说，个体工商户都独立经营，与其他单位无联系。但也有例外，比如法人股东及其亲属和配偶开设的个体工商户，虽然它们也独立经营，但如果有关注资关系，则可能需要申报自然人扣缴系统。因此，个体工商户所得税的缴纳问题，要看具体的情况而定。