记账首先要根据合伙企业进货50万、运费3万的情况进行记账，首先在货物和原材料分录中借货物和原材料50万，且贷客户xx公司，表明货物和原材料由客户购买，并在银行存款账户分录中借银行存款3万，且贷货物和原材料3万，表明款项由客户抵付，即明确合伙企业由代表公司付款，最后再在应付职工薪酬分录中借职工薪酬3万，贷应付账款3万，表明款项由合伙企业支付给运输公司。 以上为合伙企业进货50万运费3万付给运输公司的账务处理方法，有助于企业进行资金管理和核算工作，准确把握企业收支情况，拓展知识：如果在本次活动中企业产生了运费往来款，那么可以使用往来款账户去记账，可以分别记账，例如在运费支出单中借运费支出，贷往来款，在付款单中借往来款，贷银行存款，可清楚地记录运费的支出和收入，避免收支混乱造成资金损失。