员工在子公司交社保的情况下，总公司可以发工资，但需要确保两家公司有相关的协议。比如由总公司授权子公司代为完成薪资发放工作，并提交相应的税务费用。关于账目处理，总公司完成发薪工作后，应及时将子公司收到的账目归到自己凭证中，子公司也应及时将发薪账款转入总公司的账户，并及时将本期的个税扣缴给国家税务机关。 以上是完成账目处理和相应税务缴付的正确流程，其中可拓展的知识点有：薪资工资总额国家及地方限额；有关劳动荣誉金发放、社会保险缴纳等等。另外，还需要熟悉有关税务所得税法规。