当他人单位转账到我公司公户上收的款比开票金额多时，我们需要按照以下步骤做账： 1.首先，应当记录所收金额，以便实施内部核对。 2.填写记账凭证，记账时应当登记其他单位的转账金额，并核对其开票金额是否正确，若发现金额不一致，应及时与他单位核实。 3.填写收款银行转账凭证，确定金额，以便抵扣应税项目。 4.在收入科目中记账收款金额，金额记录应当以实际收到的金额为准。 5.在支出科目中填写相应的金额，将多余收款金额付款给他单位。 拓展知识：在做账过程中，应特别注意发票核对，确保收到金额与开具发票金额一致，并应经常对账，在有异常情况时，及时发现和处理。