由法院开具发票，法院拍卖的土地和厂房还银行贷款，具体流程如下： 1、由法院受理银行贷款催收诉讼案件； 2、一旦受理，法院将会在合法、公开的拍卖会上拍卖该土地或厂房； 3、若拍卖能够实现清偿，法院将开具有关拍卖收入清偿的发票； 4、拍卖后，法院出具财产抵偿结果通知书，将财产抵偿结果及其他相关程序交付债权人； 5、债权人拿着发票，和通知书去银行办理还款手续，以及将抵偿金额转入银行账户。 拓展知识：法院在拍卖土地厂房的过程中，对投标方要求拍卖保证金，若中标者拍卖后放弃拍卖权，则法院保留拍卖保证金，减少未能清偿的债务额，保护债权人的利益。