变更分公司负责人应当遵循《中华人民共和国企业法》第三十条规定，需要依法召开股东大会，讨论该事项，经三分之二以上股东表决通过后再由董事会据此表决决定，最后再履行颁发新负责人的手续以及采取其他形式的宣传活动，以免给公司的正常经营带来不利影响。 变更分公司负责人在深圳时，其办理流程为： 1、应依法召开股东大会，根据《中华人民共和国企业法》第三十条规定，进行提议并进行讨论； 2、就变更负责人进行表决，表决通过率高于三分之二； 3、由董事会根据股东大会表决决定； 4、颁发新负责人文件，由原负责人主持离职仪式，以确保公司正常经营； 5、对新任的负责人进行公司职能的介绍，以及领导宣传知识的活动，以加强公司责任感。 拓展知识：在变更分公司负责人时，还要注意变更手续的完备性，包括变更报关及报检申报资料，以及其他主管部门的变更手续，包括办理新负责人的工作证、资质审核及其他报备的手续，确保完整的变更程序。