合伙企业的个人生产经营所得应纳税额的计算公式是：所得税 = 应纳税所得额 × 税率－速算扣除数。其中，应纳税所得额为个人生产经营所得减去该项目可享受的减免所得额和免税额后的金额，税率根据企业的纳税义务人类别、所得项目以及所处的税率期不同而有所区别，速算扣除数的金额也有所不同。 合伙企业的个人生产经营所得税的计算有很多种类，包括非财产性收入、特殊扣除在内的增值税小规模纳税人的营业收入以及一般纳税人的营业收入。拓展知识：税收契约原则是指企业与税务机关就纳税义务规定的签订的协议，税收契约原则赋予企业与税收机关保持协商、灵活处理、及时调整的权利。