是的，合同结束时间是2021年6月，开发票是21年底开进来是合理的，因为在合同结束之后，可能会有某些需要补偿的情况出现，双方需要在发票到达之前讨论，并且需要一段时间来收集材料以及完成发票的结算，而21年底发票到达是可以接受的。除此之外，另外一个重要的拓展知识，就是关于合同结算的时间，一般来讲，合同结算要在合同结束之前完成，方可释放合同，所以在2021年6月发票到达前，双方应该在实际合同费用清算完毕之前，把实际结算清楚，以免出现纠纷。