在注销分公司时，可以将分公司的研发支出并入总公司账户研发科目，但是需要根据实际情况办理，确保账目合法、透明。此外，对于研发科目而言，根据会计准则及税法，有些研发科目需要按照一定比例缴纳税款，有些研发科目可以免征税款，因此，在缴税时，需要根据分公司相关税法规定进行缴税，不能擅自调整税收条款，这样会造成大量不必要的经济负担。另外，如果把分公司的资金归还给总公司并未缴税，这会给总公司带来财务风险，以及增加审计的难度，因此，在注销分公司过程中，一定要引入专业的会计师、税务师，确**程合规安全。