作废的发票需要按照普通发票和专用发票进行分类保存。普通发票应按原开票系统的顺序分组保存；专用发票应按照发票内容，具体按照出库收入，服务收入，进项税额及税款，财政补贴等进行分类保存。 拓展知识：作废的发票，需要定期归档，按年分存放，并注明日期，以便查询；作废的发票必须与正票一一对应，不能随意更改，以免税务稽查。此外，对于使用税务电子稽查系统的单位，作废发票需要在电子稽查系统里进行客户归档，以备日后审计，否则可能会受到税务严厉处罚。