工商年报纳税总额不包括水里基金、印花税、残保金、工会筹备金等，它们不被认定为税费。水里基金是指住宅用水费或者商业用水费收取的一种形式，主要用于修建一些水利基础工程，而印花税是一种消费税，政府规定消费行为所应缴纳的税款，而残保金就是由残疾人支付的一种保险费用，以保障残疾人的健康权益；而工会筹备金是指工会在正式成立前，用以收支及储备的一种应急金。因此，以上几项并不属于纳税总额所包括的范围。 此外，纳税总额还不包括由政府财政拨款产生的税款，以及一些政策性减免税款，政府对金融等机构的补助，以及不同地区的免税和税收优惠政策等。 总的来说，工商年报纳税总额主要以企业和个人交纳的所得税、增值税、营业税等为主，是由企业和个人实际支付的税费作为基本纳税计算依据。另外，还应该注意地方政府等对税收的征收，例如对彩票、赌博等取款活动，以及特定行业税收减免等政策问题。