小规模开专票需要缴纳增值税，但不能抵扣税款，因为小规模纳税人的扣税标准和一般纳税人是不同的，小规模纳税人的扣税标准要比一般纳税人低。小规模纳税人需要按照规定的税率提交营业税和增值税，而不能抵扣税款，这就是小规模开专票时不能抵扣增值税的原因。 此外，小规模普通发票和专用发票也有区别，小规模普通发票和专用发票有明显的不同点。小规模普通发票只能开具营业税，不能开具增值税；而小规模专用发票中除了营业税，还可以开具增值税。小规模专用发票的开票税率需要按照规定来办理，不能抵扣税款，这也就是不能抵扣增值税的原因。