上海公司在杭州开了分公司，但由于不独立核算，所有费用发票、销售开票、收款都由上海公司来申报，这就意味着所有账务都必须由上海公司完成，即费用发票、销售发票和收款都须由上海公司统一安排，否则不能符合证照要求和后期报税等工作。同时，这也就意味着，无论是上海公司还是杭州分公司，他们都必须遵守上海公司的内部账务操作流程和财务审计程序，以确保杭州分公司的收支合法正常，以及上海公司的财务有序运转，以达到杭州分公司的正常经营和上海公司的财务目标。 拓展知识：分公司的申请和开办一般需要提交的资料有：一、企业基本资料；二、分支机构注册资金及其他需要证明材料；三、分公司营业执照和分支机构代表人身份证复印件；四、资质证书；五、企业经营范围的证书；六、经营场所的租赁合同/业主授权书等。