小规模纳税人公司的注销流程如下： （1）经营者准备注销小规模纳税人材料，包括全体股东或发起人会议通过小规模纳税人注销决议； （2）准备注销材料，有小规模纳税人资格证书，小规模纳税人登记表、法人登记证明，股东会议小规模纳税人注销决议； （3）提交小规模纳税人注销申请，携带上面准备好的材料，到税务机关进行申请； （4）根据税务机关审核完毕，申请有效，税务机关对小规模纳税人进行注销，将小规模纳税人登记表及小规模纳税人资格证书相关声明吊销； （5）税务机关审核完毕，发放注销证明。 拓展知识：小规模纳税人公司注销后，应继续履行义务，如已确认的税费应按期支付；经营者需向税务机关报送税务报表，并按照规定清缴税费，直至税务机关出具注销证明；除此之外，还需办理注销企业营业执照和社会保险等相关手续。