是的，5月底这个员工离职，及时办理了减员，社保局也已经收到变更减员申请，6月份就不应该再扣这个员工个人社保部分了。 个人社保是指社会保险和住房公积金，其中，社会保险包括养老保险、医疗保险、失业保险和工伤保险，住房公积金是指住房公积金的金额。每月的个人社保都有企业和员工分别支付部分，以及一定的比例，它们是按月支付的。在正常情况下，当社保和住房公积金未及时缴纳时，会带来相应的处罚。 此外，社会保险和住房公积金是用于保护劳动者的权益，保障其正常工作和生活，因此员工在办理离职手续时，应注意及时办理社会保险和住房公积金的减员，以免因社保和公积金未及时缴纳而带来不必要的处罚。