应纳税所得额小于100万元的小微企业适用税率为5%。根据《企业所得税法》第四十九条、《企业所得税法实施条例》第三十五条规定，符合小微企业税收优惠政策规定的小型微利企业，可以按照5%的优惠税率计算所得税。 此外，从2018年10月1日起，根据国家税务总局公布的新政策，小微企业收入不超过300万元，且符合小微企业税收优惠规定条件，可享受更低的税率，即3%的税率。 由于小微企业受当前经济形势的影响较大，国家出台的各种税收优惠政策，对小微企业的发展形成了有利的改变，有助于小微企业的发展，让小微企业能够得到更多发展机遇。