如果汇算清缴时发现实发工资比申报的工资多，应该根据实际情况，按照税收规定进行处理。 首先，应当与职工核对，确定实际工资是否高于申报工资，以及原因是什么。例如，职工补缴工资后收入高于申报收入，或是发生其他复杂情况等等，应根据实际情况，实事求是地记录与确认。 其次，职工高于申报的应税收入应以实际发生的金额为准，应继续按照税收居民收入申报程序，对相应的应纳税所得额进行申报。在申报过程中，职工应将实际获得的收入准确申报，按照税务部门相关政策，如有必要，职工应履行相应的缴税义务。 最后，随着税收规则的变化和完善，企业应积极把握变化的规定，及时调整税收管理机制，确保税收缴纳的准确性和合法性，保证企业税收管理的有效性与科学性。 拓展知识：税收申报的准确性和合法性，还受到公开信息影响，特别是企业客户的税收申报可以受到公开披露的利润表、财务报表等会计信息影响，因此，企业客户应加强对公开信息的审查和确认，以保证税收申报的准确性和合法性。