农村商业银行和农商银行也被称为农村合作银行，他们都是中国农村商业银行系统的重要组成部分，但它们还有一些区别。农村商业银行的业务面向的是大多数的农民和农村客户，他们的定位是服务农村而不是支持和改变农村社会结构；而农商银行的业务范围和客户类型更广，它们的定位是支持和改变农村社会结构，依靠自身的力量推动农村经济发展。针对开发票的问题，由于农村商业银行和农商银行是有区别的，因此在开发票把农村商业银行写成农商银行上不太紧要，但应该避免把农村商业银行错误地写成农商银行。 关于农村商业银行和农商银行，除了上述不同点，农村商业银行拥有独立的经营组织，实行以资产负债表为核心的财务管理；而农商银行的经营组织是以农业联合社团体为基础，以农业联合社客户及其资产信托为中心，由合作社成员支付的投资帐户和其他财务活动作为经营资本实现财务会计。因此，两者的运作模式是有明显差异的，具体以实际运用为准。