对于新公司买车子不能上牌而只能登记在个人名下，车子是为公司所用，合理扣除的情形，应该遵循纳税法规中有关“劳务报酬”的规定。具体来说，公司可以向个人支付所称的“车费”，公司将该费用列入个人薪金收入，并在当期发放时扣除当月应缴纳的个人所得税，从而符合税务管理规定。 此外，公司可以支付给个人“车辆维修保养费”，在按照税务有关规定办理个人所得税缴纳手续时，可以抵扣个人税费，从而达到减少个人税费的目的。 考虑到个人购车上牌未能落实，可以建议个人在支付车费等财务报销时，务必由公司向个人开具正规发票，以规范发票形式证明双方的财务交易，以有效规避税务上的风险。