是的，要填写期末留底退税申请表，包括：期末留底退税申请书、累计期间应纳税所得额期末留底凭证、税收期末留底现金对账单、税收期末留底银行存款账户对账单、币种合计不足税额5%缴纳汇票复印件、代扣代缴凭证、申报关系（纳税人识别号）。期末留底退税申请表是企业及其扣缴义务人在同一税款期间完成了累计税额征管，但由于其他原因，导致未能按时进行纳税义务退税等，从而产生未交的税款的，由发票正本的真实性、合法性、有效性决定扣缴义务人本期计算扣除的税款，经税收机关审核实行退税结算的，需向税收机关提出期末留底退税申请。 拓展：针对期末留底退税申请，税务部门有一定程序，实行税务审核和财务审核。税务审核主要查询申报税种、纳税状态、申报金额与实际发票金额是否一致及其他审计情况；财务审核则要求清楚说明退税申报原因，至关重要的是要解释申报的金额形成的原因。