根据业务流程来看，当母公司发放工资时，就需要扣除个人社保部分。而实际的社保交纳，是在子公司进行的，母子公司之间可能还需要进行往来，那么确定做往来的附件，可以使用往来业务凭证进行证明。例如，母公司发放工资的凭证，以及子公司缴纳社保的凭证，这样可以清楚地证明母公司发放个人社保扣款，并由子公司缴纳，从而确认母子公司间的往来。 此外，确定母子公司之间的往来，可以根据会计准则来处理。例如，当母公司发放工资时，可以在发放凭证上标明扣除的个人社保部分，子公司收到发放凭证后，确认缴纳社保的凭证上也应标明收取的费用，以便证明母子公司之间往来的情况。此外，母公司发放工资前，还可以签订书面协议，确认双方都明白往来的情况，以及双方之间承担的义务。