根据财务会计处理的规范，应该按照原来凭证的金额进行冲红，所以此处应该冲红5000元，然后重新开一张发票，支付4000元。冲红凭证可以理解为是原凭证的反向凭证，所以它应该和原凭证按照余额冲红，不可以冲红1000元，即便它错了也要按照原来支付的金额重新冲红。 冲红凭证的概念是一种负账户，用于调节账户余额，当账户余额有误时，可以利用冲红凭证调整账户余额，从而使账户余额保持准确，可以避免出现结算不准确或不结算的情况。