首先，如果分包单位预缴了税款，那么总包在预缴的时候是不能够扣除分包款的。这是因为，总包不能把自己的税款扣除给分包单位，而是将其完全用于自己的税务管理。要证明分包单位预缴了税款，首先需要提供预缴税款证明文件，即税表编号（税表编号即税款预缴受理单编号）。另外，可以凭借分包单位纳税识别号、税款扣除受理单号查询税收缴纳情况，以及通过审计税收专项检查结果等进行证明。 此外，一般来说，税款预缴的证明文件要交给税务机关，特殊情况下可以证明财务账簿等资料。一次性预缴税款，可以在预缴期内做补缴，若超出时限，当然也可以缴纳滞纳金。税务机关会根据提供的证明文件和账簿分析，确定是否完成了税款预缴。