法院扣取的案件受理费和违约金应记入财务会计科目，具体如下： 案件受理费： 受理费一般记入应收账款（借）和案件受理费收入（贷），案件受理费可能伴有代缴的税款，税款支出（借）和应交税费（贷）。 违约金： 违约金一般根据合同约定确定，记入应收账款（借）和违约金收入（贷），违约金可能也伴有代缴的税款，税款支出（借）和应交税费（贷）。 拓展知识：财务会计科目是会计工作者比较重要的内容，是会计工作中使用的基本术语，它们由有关财务活动所引起的增加、减少或转移时要记录的会计单位。会计科目是用于记录会计信息的基础，是会计信息形成系统的节点。科目的基本特征是按事物分类、按性质分类和按方向分类。