根据《合同法》规定，双方约定的抵扣是可行的。甲乙双方可以通过协商，约定乙方支付的租金可以抵销乙方向甲方支付的装修材料费用，双方可以在合同中明确约定抵扣方式，乙方可以以租金的形式支付装修材料费，双方只有签订合同、明确合同条款，确认双方所有权利义务的情况下，才能有效履行合同规定的双方权利和义务。此外，双方约定的抵扣也受到具体纳税实体的影响。若具体税务实体是企业，则应遵循企业所得税法律规定，如果被抵扣项目涉及到房地产销售，需要缴纳增值税；若具体税务实体是个人，则根据个人所得税法的规定，可以减免相应的税款。因此，在双方抵扣问题上，仍需要根据不同的具体情况以及税务实体的影响，综合评估后再做出最终的决定。