答：在一个人在两家公司都发有工资，按照工资薪金申报，年度汇算清缴时要补税的情况下，两家公司实际承担的税的算法是：（1）每个公司根据自己发放的工资计算应扣缴税款；（2）根据税收管理机关给出的两家公司发放工资情况，计算出当年应收税款；（3）减去第一步计算出的每家公司应扣缴税款，就算出两家公司实际承担的税款数额。拓展知识：在补税的情况下，根据《中华人民共和国个人所得税法》第九十五条的规定，税收管理机关可以根据纳税人的实际情况采取给予缓缴、收缩期限或分期缴纳、减免税等措施，进一步减轻纳税人的负担。