对于建筑劳务分包公司在异地有项目，可以在异地预缴税款，这个答案是肯定的。甲方在总公司开发票，也是可以的，但是要视具体情况而定，以最新的税收政策为准，关于票据开具，一般来说，纳税人是按照本纳税人地区开具发票的。 就建筑劳务分包而言，如果当地项目有注明申报发票地，那么发票开具地就可以按照申报的发票地去开具发票。如果没有申报，那么也可以按照劳务派遣公司的纳税地开具发票，但是个人认为最好是照项目申报发票地来开具发票，为了避免出现税务问题。 此外，在建筑劳务分包公司异地预缴税款时，需要注意发票开具地与税务局确认的纳税地是否一致，以免出现税收违规问题。除此之外，还要注意适用税种、税率和纳税日期。