国税系统打印资产负债表、利润表和科目余额表的操作流程是：1.登录国家税务总局官网，进入国家税务总局信息共享门户，按照要求填写纳税识别号和登录密码。2.登录后，进入“财务会计信息管理”模块，选择“会计报表”功能，根据选择的月份和报表类型，打印资产负债表、利润表或科目余额表。3.若要下载报表，可以点击“打印”按钮，选择“电子文档”格式，下载相应文件。 拓展知识：资产负债表是企业财务状况的一面镜子，可以反映企业财务状况，而利润表则可以反映企业盈利情况，科目余额表显示每一类科目下账户所有借贷发生额和余额。这三种报表都是企业会计体系中非常重要的报表，企业要根据国税系统定时上报相应报表。