注册e窗通帮助企业办理营业执照的风险是存在的，因为营业执照是一个企业必备的合法文件，企业申请营业执照时需要注意填写信息正确，不准确完善的信息会导致营业执照被取消，责任由企业本身承担，如果涉及到违法犯罪行为，还会遭到法律处理。 另外，在办理营业执照材料方面，需要提供企业营业地址、注册地点、法人代表、法人身份证等，必须真实，否则会被取消营业执照的资格，因此，在使用e窗通办理营业执照时，应该加强对信息的审核，确保所提交的材料真实有效。 此外，还有可能出现e窗通的技术和服务质量的问题，如发生故障影响正常服务，影响营业执照办理，造成企业就办理营业执照须花费更多的成本和时间去办理。因此，企业在使用e窗通办理营业执照时，需要确保e窗通的服务质量，选择较为可靠的服务提供商，以减少风险。