农民工专户可以支付工资以外的款项，但具体情况要根据当前的法律规定和相关交易约定来确定。在有当地劳动部门监管的情况下，企业和农民工订立书面服务协议后，企业可以向农民工支付工资以外的款项，以补偿农民工因受伤、患病、遭受家庭状况变化而导致收入变少的问题。例如，企业可以支付农民工生育补贴、灾害性补偿金等。但是，在支付这些款项时，企业必须做好相关事实的记录和凭证，以便更好地了解农民工收入的状况，并依法缴纳相关税收。 拓展知识：农民工专户是组织农民工收入和支出的账户，由劳动部门管理，主要用于支付工资和福利。企业要将每月作业农民工的工资及社会保险等款项存入农民工专户，确保农民工的合法权益。