小规模纳税人在软件开发行业有企业所得税和个人所得税两种税种。企业所得税的税率为25%，个人所得税的税率则是20%。综合税率是根据一定的税收规则计算得出的，它可以反映企业所得税、个人所得税、增值税等所有税种的比重，也就是把这几种税种的税率联结起来组成一个总的税率，这个总的税率就是综合税率。要计算综合税率，需要知道企业所得税税率、个人所得税税率、增值税税率等。具体的计算方法为：综合税率=（企业所得税税率*企业所得税数+个人所得税税率*个人所得税数+增值税税率*增值税数）/(企业所得税数+个人所得税数+增值税数)。拓展知识：小规模纳税人免征增值税，免征消费税，按简易办法缴纳企业所得税，企业所得税税率较常规企业税率低。