首先，根据法律规定，你们应该退回发票；其次，你可以根据入账时间，财务凭证等证据，去确认已支付的费用是否与发票金额一致。如果不一致，则可能是对方在发票中记录了错误的费用，你可以要求对方更改错误的发票；如果一致，则表明已支付的费用已被记录，你们应该退回该发票。另外，在今后的商务交易中，要注意细节，保存相关凭证，以免不必要的纠葛。