货物单价和运费分别列明的话，在开票的时候只能将运费开到发票的税额部分，不能把运费开到货物单价里面，这样开票会违反税收管理规定，会影响企业的纳税资质，也会影响企业的征税诚信水平，极可能引起税务查处。税收法律规定，公司发票要明确显示质量、数量和单价，包括运费不能对货物的单价进行填写，只能作为本项目文库的税率条款，来作为发票税率的依据，也可以将运费列在明细处。 需要强调的是，为了减少税收管理纠纷，除了要遵守税法规定，在开具发票时，企业还应引以为鉴，严格遵守发票管理规定，提高发票管理水平，按照规定正确填写发票内容，避免违反税收管理规定。 综上所述，运费不能把运费开到货物的单价里面，这样开票会违规，企业应该按照规定正确填写发票内容，特别是在开具发票时，必须根据开出发票的实际情况进行填写，同时也要注意遵守税收管理的规定。 此外，对于开票的有关知识，企业可以采取自主学习的方式，结合实际情况，及时补充、深入学习企业申报纳税细则相关知识，增加业务水平和技能水平，提高发票管理水平。