电子专用发票作废的步骤有： 1、登录商户系统，在“发票管理”功能模块中查找要作废的电子专用发票记录，点击查看详情； 2、进入发票详情界面，点击“作废”按钮； 3、输入作废原因（如：发票出现重复开具、手机失败等）； 4、提交审核； 5、税局审核通过后，发票状态会变更为“已作废”； 有效期内的电子专用发票可以随时作废，已过期的电子专用发票不能作废。为了避免误作废的情况，可以按照以上流程操作，使用前先查看发票的有效期，再决定是否作废。 拓展知识： 税局提供的电子专用发票有很多优点，不仅可以节省增值税的筹划空间，而且更方便企业申请各种补贴。电子发票不仅能节约企业成本，减轻劳动强度，而且可以控制后台时间，加快发票过渡，使发票管理更加便捷、准确、高效。