项目单独核算应该建立单独的账户，实行“专款专用”原则，将两家公司之间的转账资金都归入到该账户，并且严格按照每一笔收入/支出记录下来，以便进行专项核算。 我们如果需要实现项目单独核算专款专用的话，除了建立专项账户，还要采取一些特殊措施，例如加强对资金使用的监督，建立项目专项账户日常账务处理制度，以及账户的安全认证措施等，以确保项目金额的准确性和安全性。另外，对账务处理结果要进行审计检查，保证资金使用及时有效且安全有序。