一般纳税人在填写增值税申报表时发票上开具6%税率的咨询费应填写在3.6.2栏中，即金额扣除项目中的服务、不动产和无形资产及其他收入项目栏，填写时要注意，有的地方发票分类较多，有的费用办理过程中被分为多项，这些都需要按照实际情况填写，但最终都需要在金额扣除项目中加起来，填写到本表第3.6.2栏中。另外，在填写税费申报表时，一般纳税人还应注意税收减免和税务协定的适用，例如有的收入可以享受减免的税收，有的收入可以按照税务协定征收税收，这些都需要纳税人了解。