可以的，按实际缴纳的水费做账是可行的，可以防止实际开票金额和实际交纳金额不一致，有助于财务部门记账和核算，减少记账和核算的出错风险。 据财务规程规定，应按实际缴费凭证登记，如果实际缴费少于实际开票金额，考虑把实际开票金额退回给缴费人，如果缴费多于实际开票金额，可以减少缴费金额的支出，增加账户的余额。 此外，如果存在实际交费金额和实际开票金额不一致的情况，可以根据财务规程，建立相应的凭证归档，及时处理相关结算问题。这样不仅可以防止实际缴费和实际开票金额不一致，还可以建立良好的财务档案，有助于账务的准确性和完整性。