按照《中华人民共和国企业会计准则》第二十五号条文的规定，工会筹备金按实际发放的工资数额进行扣税。因为申报的工资可能存在某些优惠政策，如个人所得税减免政策，而实际发放的工资就不在此列，其中的税费则由工会筹备金支付。如此规定可以确保政府和劳动者在各自领域受益，也符合当前国家财政政策和税收法规政策要求。此外，根据国家规定，个人所得税扣缴率最低不低于4.0％，最高不高于45％。根据实际工资情况，可以确定应缴税款扣缴比例，以期落实财政征税要求。拓展知识：由于工会筹备金的性质是“为增强工会能力，丰富工会活动内容”，所以只有在“实际发放的工资”的基础上才能保证资金的有效使用，从而达到最大的价值。