企业第一次缴纳个税的操作可以分为以下几个步骤： 1.首先，企业应该先申请纳税人资格，企业第一次申请纳税人资格，需要提供必要的资料，包括企业法人营业执照、组织机构代码证、税务登记证等。 2.然后，在开户银行进行个税开户登记，银行会提供账户编号和汇缴码，用于缴纳个税。 3.接着，企业应当在每个月开始的第五个工作日，按照税务机关的规定，填制个税申报表，上传申报表至税务机关的网站，确认无误。 4.最后，选定个税支付方式，可以选择银行汇缴、网上支付等。支付时记得要准备足够的税金和个税账户对应的账号、汇缴码，以及上传申报表的网上交易流水号。 拓展：企业缴纳个税时，在计算应缴税款时,有可能超出纳税人的缴款能力，如何解决呢?可以申请税务机关开具个税安排协议书，分期缴纳税款，由税务机关与纳税人签订个税安排协议书，根据实际情况，确定纳税人的每月缴纳数额，由税务机关授权的跨行汇总纳税机关收税。