处理留底退税账务，主要包括以下几个步骤： 1、根据税务部门的通知，确定原税种、原税额； 2、填写申报表格，把留底退税申报表附加到主表中； 3、核实申报表中的相关信息，确认无误后，把申报表及相关数据纸质复印件准备好； 4、准备所需要的财务凭证，如销售合同、发票，准备好纸质复印件； 5、按照税务部门的要求，把申报表和相关的凭证提交给税务部门； 6、把收到的退税凭据，记入账务账簿，并做出相应的记账凭证和报表； 7、把退税金额，按照财务规定的支付流程，转入企业的银行账户。 拓展知识：当申报留底退税时，企业要根据税务部门的规定逐条填写原税种、原税额，以及退税种、退税额等信息，以准确地确定是否可以享受留底退税政策。