在准备注销公司的过程中，针对有未勾选的进项税，需要根据相关税收法律来进行处理，一般情况下，企业应当尽快在有税负的情况下，按照税务局的规定，对自己完成注销程序之前的税款进行舍弃，然后在撤销的时候可以向税务局申请抵扣退税。同时，注销前也可以提交申请，把税款抵扣提前完成，可以加快注销流程。 除此之外，在公司注销前，还需要提醒财务人员，要多注意税务登记证等相关资料的确认和保管，确保资料的完整性和准确性，以便今后退税等事宜做出必要的配合。此外，需要注意查验和保存税务机关出具的相关证件，以备万一申请时出现不以的情况时作为查证凭证。