是的，当小规模纳税人是按照3％的税率支付税款时，即使别的企业给小规模纳税人开票，他们也必须缴纳增值税。因为增值税是按照发票金额计算的，而不是按照税率计算的，所以小规模纳税人仍然须缴缴纳增值税，发票上的税率不会影响增值税的计算。 拓展知识：增值税是政府向企业征收的税种，它主要针对企业的销售现金流动，政府通过调节增值税的收入来调节财政收入，控制宏观经济，促进社会发展和财政收支平衡，增值税是一种流动性税种，给企业带来比较大的负担，政府需要加大税收优惠政策，减轻纳税人的负担，促进社会经济发展。